Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IRX1P78414 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX1P78414 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX1P78414 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX1P78414 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX1P78414 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX1P78414 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX1P78414 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX1P78414 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX1P78414 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX1P78414 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX1P78414 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX1P78414 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX1P78414 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX1P78414 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX1P78414 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX1P78414 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX1P78414 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX1P78414 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX1P78414 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX1P78414 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX1P78414 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX1P78414 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX1P78414 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX1P78414 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX1P78414 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX1P78414 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX1P78414 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX1P78414 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX1P78414 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX1P78414 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX1P78414 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX1P78414 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX1P78414 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX1P78414 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX1P78414 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX1P78414 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX1P78414 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX1P78414 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX1P78414 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX1P78414 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX1P78414 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX1P78414 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX1P78414 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX1P78414 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX1P78414 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX1P78414 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX1P78414 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IRX1P78414 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRX1P78414 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRX1P78414 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRX1P78414 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRX1P78414 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRX1P78414 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRX1P78414 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRX1P78414 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRX1P78414 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRX1P78414 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRX1P78414 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRX1P78414 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRX1P78414 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRX1P78414 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRX1P78414 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRX1P78414 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRX1P78414 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRX1P78414 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRX1P78414 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRX1P78414 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IRX1P78414 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IRX1P78414 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRX1P78414 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRX1P78414 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IRX1P78414 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRX1P78414 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IRX1P78414 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRX1P78414 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRX1P78414 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IRX1P78414 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRX1P78414 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRX1P78414 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRX1P78414 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRX1P78414 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRX1P78414 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRX1P78414 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
IRX1P78414 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRX1P78414 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRX1P78414 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRX1P78414 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IRX1P78414 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms