Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSNK2A1P68400 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSNK2A1P68400 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms