Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CSNK2BP67870 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CSNK2BP67870 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms