Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms