Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP3P54852 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP3P54852 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP3P54852 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP3P54852 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP3P54852 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP3P54852 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP3P54852 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP3P54852 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP3P54852 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP3P54852 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP3P54852 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP3P54852 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP3P54852 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP3P54852 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP3P54852 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP3P54852 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP3P54852 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP3P54852 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP3P54852 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP3P54852 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP3P54852 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP3P54852 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP3P54852 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP3P54852 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP3P54852 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP3P54852 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP3P54852 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP3P54852 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP3P54852 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP3P54852 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP3P54852 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP3P54852 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP3P54852 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP3P54852 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP3P54852 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP3P54852 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP3P54852 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP3P54852 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP3P54852 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP3P54852 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EMP3P54852 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP3P54852 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP3P54852 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP3P54852 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP3P54852 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP3P54852 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP3P54852 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP3P54852 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP3P54852 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP3P54852 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP3P54852 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP3P54852 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP3P54852 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP3P54852 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP3P54852 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP3P54852 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP3P54852 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP3P54852 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP3P54852 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP3P54852 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP3P54852 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP3P54852 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP3P54852 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP3P54852 ADAM3A-209ENST00000497806 1245 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP3P54852 UCHL1-AS1-202ENST00000510073 451 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP3P54852 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP3P54852 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP3P54852 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP3P54852 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP3P54852 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP3P54852 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP3P54852 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP3P54852 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP3P54852 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP3P54852 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP3P54852 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP3P54852 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP3P54852 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP3P54852 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP3P54852 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP3P54852 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP3P54852 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP3P54852 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP3P54852 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EMP3P54852 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EMP3P54852 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EMP3P54852 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EMP3P54852 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EMP3P54852 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EMP3P54852 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EMP3P54852 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EMP3P54852 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EMP3P54852 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMP3P54852 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMP3P54852 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMP3P54852 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMP3P54852 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EMP3P54852 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EMP3P54852 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms