Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SMARCA4P51532 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SMARCA4P51532 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms