Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERFP50548 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERFP50548 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERFP50548 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERFP50548 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERFP50548 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERFP50548 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERFP50548 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERFP50548 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERFP50548 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERFP50548 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERFP50548 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERFP50548 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERFP50548 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERFP50548 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERFP50548 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERFP50548 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERFP50548 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERFP50548 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERFP50548 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERFP50548 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERFP50548 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERFP50548 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERFP50548 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERFP50548 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERFP50548 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERFP50548 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERFP50548 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERFP50548 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERFP50548 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERFP50548 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERFP50548 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERFP50548 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERFP50548 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERFP50548 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERFP50548 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERFP50548 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERFP50548 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERFP50548 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERFP50548 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERFP50548 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERFP50548 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERFP50548 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERFP50548 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERFP50548 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERFP50548 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERFP50548 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERFP50548 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERFP50548 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ERFP50548 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERFP50548 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERFP50548 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERFP50548 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERFP50548 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERFP50548 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERFP50548 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERFP50548 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERFP50548 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERFP50548 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERFP50548 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERFP50548 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERFP50548 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERFP50548 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERFP50548 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERFP50548 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERFP50548 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERFP50548 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERFP50548 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERFP50548 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERFP50548 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERFP50548 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERFP50548 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERFP50548 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERFP50548 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERFP50548 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERFP50548 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERFP50548 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERFP50548 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERFP50548 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERFP50548 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERFP50548 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERFP50548 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERFP50548 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERFP50548 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ERFP50548 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ERFP50548 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERFP50548 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERFP50548 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERFP50548 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERFP50548 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERFP50548 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERFP50548 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERFP50548 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERFP50548 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERFP50548 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ERFP50548 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERFP50548 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERFP50548 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERFP50548 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERFP50548 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms