Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF6P49848 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF6P49848 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF6P49848 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF6P49848 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF6P49848 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF6P49848 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF6P49848 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF6P49848 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF6P49848 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF6P49848 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF6P49848 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF6P49848 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF6P49848 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF6P49848 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF6P49848 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF6P49848 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF6P49848 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF6P49848 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF6P49848 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF6P49848 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF6P49848 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF6P49848 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF6P49848 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF6P49848 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF6P49848 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF6P49848 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF6P49848 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF6P49848 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF6P49848 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF6P49848 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF6P49848 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TAF6P49848 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF6P49848 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF6P49848 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF6P49848 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF6P49848 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF6P49848 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF6P49848 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF6P49848 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF6P49848 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF6P49848 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF6P49848 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF6P49848 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF6P49848 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF6P49848 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF6P49848 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF6P49848 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF6P49848 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF6P49848 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF6P49848 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF6P49848 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF6P49848 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF6P49848 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF6P49848 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF6P49848 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF6P49848 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF6P49848 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF6P49848 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF6P49848 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF6P49848 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF6P49848 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF6P49848 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF6P49848 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF6P49848 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF6P49848 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF6P49848 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TAF6P49848 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF6P49848 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF6P49848 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF6P49848 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF6P49848 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF6P49848 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF6P49848 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF6P49848 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF6P49848 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF6P49848 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF6P49848 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF6P49848 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF6P49848 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF6P49848 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF6P49848 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF6P49848 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF6P49848 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF6P49848 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF6P49848 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF6P49848 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF6P49848 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF6P49848 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF6P49848 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF6P49848 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF6P49848 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF6P49848 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF6P49848 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF6P49848 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF6P49848 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF6P49848 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF6P49848 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF6P49848 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TAF6P49848 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms