Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KRT6CP48668 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms