Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CRATP43155 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRATP43155 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRATP43155 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRATP43155 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRATP43155 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRATP43155 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRATP43155 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRATP43155 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRATP43155 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRATP43155 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRATP43155 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRATP43155 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRATP43155 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRATP43155 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRATP43155 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRATP43155 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRATP43155 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRATP43155 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRATP43155 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRATP43155 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRATP43155 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRATP43155 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CRATP43155 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRATP43155 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRATP43155 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRATP43155 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRATP43155 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRATP43155 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRATP43155 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRATP43155 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRATP43155 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRATP43155 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRATP43155 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRATP43155 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRATP43155 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRATP43155 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CRATP43155 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRATP43155 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRATP43155 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRATP43155 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRATP43155 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRATP43155 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRATP43155 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRATP43155 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRATP43155 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CRATP43155 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRATP43155 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRATP43155 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRATP43155 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRATP43155 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRATP43155 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRATP43155 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRATP43155 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRATP43155 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRATP43155 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRATP43155 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms