Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ITGAEP38570 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ITGAEP38570 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms