Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ATP6V1E1P36543 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms