Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHI3L1P36222 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms