Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX2P28328 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX2P28328 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX2P28328 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX2P28328 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX2P28328 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX2P28328 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX2P28328 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PEX2P28328 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEX2P28328 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEX2P28328 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEX2P28328 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEX2P28328 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEX2P28328 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEX2P28328 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEX2P28328 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEX2P28328 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEX2P28328 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEX2P28328 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEX2P28328 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEX2P28328 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEX2P28328 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEX2P28328 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEX2P28328 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEX2P28328 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEX2P28328 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEX2P28328 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEX2P28328 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEX2P28328 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEX2P28328 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEX2P28328 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEX2P28328 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEX2P28328 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEX2P28328 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PEX2P28328 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEX2P28328 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEX2P28328 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEX2P28328 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PEX2P28328 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PEX2P28328 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PEX2P28328 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PEX2P28328 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PEX2P28328 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PEX2P28328 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PEX2P28328 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PEX2P28328 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PEX2P28328 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PEX2P28328 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PEX2P28328 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PEX2P28328 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PEX2P28328 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX2P28328 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX2P28328 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX2P28328 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX2P28328 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX2P28328 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX2P28328 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX2P28328 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX2P28328 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX2P28328 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX2P28328 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX2P28328 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX2P28328 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX2P28328 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX2P28328 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX2P28328 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX2P28328 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX2P28328 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX2P28328 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX2P28328 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX2P28328 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX2P28328 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX2P28328 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX2P28328 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX2P28328 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX2P28328 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX2P28328 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX2P28328 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX2P28328 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX2P28328 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX2P28328 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX2P28328 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX2P28328 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX2P28328 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX2P28328 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX2P28328 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX2P28328 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX2P28328 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX2P28328 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PEX2P28328 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PEX2P28328 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms