Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms