Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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