Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT10P13645 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT10P13645 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT10P13645 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT10P13645 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT10P13645 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT10P13645 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT10P13645 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT10P13645 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT10P13645 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT10P13645 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT10P13645 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT10P13645 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT10P13645 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT10P13645 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT10P13645 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT10P13645 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT10P13645 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT10P13645 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT10P13645 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT10P13645 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT10P13645 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT10P13645 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT10P13645 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT10P13645 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT10P13645 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT10P13645 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT10P13645 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT10P13645 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT10P13645 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT10P13645 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT10P13645 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT10P13645 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT10P13645 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT10P13645 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT10P13645 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT10P13645 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KRT10P13645 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT10P13645 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT10P13645 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT10P13645 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT10P13645 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT10P13645 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT10P13645 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT10P13645 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT10P13645 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT10P13645 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT10P13645 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT10P13645 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT10P13645 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT10P13645 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT10P13645 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT10P13645 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT10P13645 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT10P13645 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT10P13645 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT10P13645 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT10P13645 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT10P13645 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT10P13645 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT10P13645 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT10P13645 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT10P13645 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT10P13645 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT10P13645 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT10P13645 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KRT10P13645 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KRT10P13645 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KRT10P13645 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KRT10P13645 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KRT10P13645 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KRT10P13645 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KRT10P13645 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KRT10P13645 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KRT10P13645 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KRT10P13645 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KRT10P13645 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KRT10P13645 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT10P13645 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT10P13645 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT10P13645 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT10P13645 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT10P13645 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT10P13645 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT10P13645 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT10P13645 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT10P13645 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT10P13645 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT10P13645 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT10P13645 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT10P13645 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT10P13645 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT10P13645 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT10P13645 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT10P13645 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT10P13645 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT10P13645 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT10P13645 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT10P13645 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KRT10P13645 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms