Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COL6A2P12110 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms