Protein–RNA interactions for Protein: P08574

CYC1, Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYC1P08574 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYC1P08574 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYC1P08574 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYC1P08574 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYC1P08574 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYC1P08574 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYC1P08574 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYC1P08574 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYC1P08574 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYC1P08574 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYC1P08574 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYC1P08574 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYC1P08574 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYC1P08574 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CYC1P08574 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYC1P08574 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYC1P08574 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYC1P08574 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYC1P08574 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CYC1P08574 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYC1P08574 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYC1P08574 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CYC1P08574 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYC1P08574 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYC1P08574 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYC1P08574 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYC1P08574 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYC1P08574 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYC1P08574 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYC1P08574 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYC1P08574 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYC1P08574 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYC1P08574 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYC1P08574 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYC1P08574 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYC1P08574 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYC1P08574 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYC1P08574 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYC1P08574 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CYC1P08574 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CYC1P08574 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYC1P08574 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYC1P08574 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYC1P08574 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYC1P08574 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYC1P08574 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYC1P08574 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYC1P08574 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CYC1P08574 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYC1P08574 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYC1P08574 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYC1P08574 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYC1P08574 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CYC1P08574 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYC1P08574 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYC1P08574 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYC1P08574 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYC1P08574 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYC1P08574 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYC1P08574 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYC1P08574 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CYC1P08574 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYC1P08574 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYC1P08574 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYC1P08574 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CYC1P08574 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYC1P08574 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CYC1P08574 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYC1P08574 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYC1P08574 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYC1P08574 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYC1P08574 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYC1P08574 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYC1P08574 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CYC1P08574 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYC1P08574 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYC1P08574 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYC1P08574 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYC1P08574 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYC1P08574 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYC1P08574 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CYC1P08574 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYC1P08574 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYC1P08574 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYC1P08574 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYC1P08574 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYC1P08574 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYC1P08574 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYC1P08574 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYC1P08574 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYC1P08574 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYC1P08574 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYC1P08574 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYC1P08574 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYC1P08574 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYC1P08574 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYC1P08574 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYC1P08574 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYC1P08574 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYC1P08574 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms