Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHOP08100 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHOP08100 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHOP08100 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHOP08100 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHOP08100 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHOP08100 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHOP08100 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHOP08100 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHOP08100 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHOP08100 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHOP08100 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RHOP08100 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOP08100 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOP08100 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOP08100 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOP08100 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOP08100 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOP08100 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOP08100 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOP08100 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOP08100 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOP08100 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOP08100 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOP08100 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOP08100 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOP08100 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOP08100 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOP08100 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOP08100 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOP08100 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOP08100 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOP08100 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOP08100 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOP08100 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOP08100 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOP08100 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOP08100 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOP08100 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOP08100 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOP08100 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOP08100 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOP08100 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOP08100 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOP08100 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOP08100 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOP08100 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOP08100 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOP08100 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOP08100 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOP08100 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOP08100 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOP08100 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOP08100 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOP08100 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOP08100 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOP08100 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOP08100 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RHOP08100 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOP08100 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOP08100 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOP08100 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOP08100 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOP08100 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOP08100 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOP08100 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOP08100 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOP08100 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOP08100 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOP08100 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOP08100 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOP08100 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOP08100 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOP08100 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOP08100 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOP08100 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOP08100 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOP08100 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOP08100 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOP08100 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOP08100 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOP08100 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOP08100 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOP08100 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOP08100 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOP08100 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOP08100 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOP08100 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOP08100 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOP08100 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOP08100 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOP08100 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOP08100 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOP08100 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOP08100 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOP08100 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOP08100 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RHOP08100 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOP08100 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RHOP08100 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms