Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
LRRTM2O43300 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms