Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLOCKO15516 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLOCKO15516 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms