Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CUX2O14529 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CUX2O14529 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CUX2O14529 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CUX2O14529 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CUX2O14529 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CUX2O14529 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CUX2O14529 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CUX2O14529 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CUX2O14529 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CUX2O14529 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CUX2O14529 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CUX2O14529 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CUX2O14529 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CUX2O14529 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CUX2O14529 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CUX2O14529 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CUX2O14529 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CUX2O14529 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CUX2O14529 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CUX2O14529 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CUX2O14529 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CUX2O14529 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CUX2O14529 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CUX2O14529 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CUX2O14529 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CUX2O14529 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CUX2O14529 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CUX2O14529 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CUX2O14529 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CUX2O14529 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CUX2O14529 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CUX2O14529 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CUX2O14529 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
CUX2O14529 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
CUX2O14529 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CUX2O14529 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CUX2O14529 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CUX2O14529 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CUX2O14529 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CUX2O14529 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CUX2O14529 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CUX2O14529 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CUX2O14529 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CUX2O14529 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CUX2O14529 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CUX2O14529 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CUX2O14529 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CUX2O14529 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CUX2O14529 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CUX2O14529 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CUX2O14529 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CUX2O14529 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CUX2O14529 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CUX2O14529 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CUX2O14529 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CUX2O14529 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CUX2O14529 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CUX2O14529 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CUX2O14529 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CUX2O14529 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CUX2O14529 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CUX2O14529 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CUX2O14529 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CUX2O14529 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CUX2O14529 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CUX2O14529 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CUX2O14529 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CUX2O14529 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CUX2O14529 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CUX2O14529 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CUX2O14529 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CUX2O14529 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CUX2O14529 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CUX2O14529 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CUX2O14529 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CUX2O14529 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CUX2O14529 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CUX2O14529 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CUX2O14529 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CUX2O14529 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CUX2O14529 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CUX2O14529 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CUX2O14529 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CUX2O14529 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CUX2O14529 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CUX2O14529 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CUX2O14529 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CUX2O14529 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CUX2O14529 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CUX2O14529 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CUX2O14529 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CUX2O14529 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CUX2O14529 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CUX2O14529 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CUX2O14529 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CUX2O14529 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CUX2O14529 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CUX2O14529 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CUX2O14529 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms