Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GFRA2O00451 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms