Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NPIPA5E9PKD4 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms