Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CLDN25C9JDP6 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN25C9JDP6 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms