Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC160A6NGH7 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms