Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A4D1N5 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
A4D1N5 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
A4D1N5 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A4D1N5 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
A4D1N5 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
A4D1N5 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A4D1N5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
A4D1N5 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A4D1N5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
A4D1N5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A4D1N5 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
A4D1N5 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A4D1N5 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
A4D1N5 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
A4D1N5 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
A4D1N5 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
A4D1N5 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
A4D1N5 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
A4D1N5 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
A4D1N5 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
A4D1N5 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
A4D1N5 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
A4D1N5 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
A4D1N5 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
A4D1N5 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
A4D1N5 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
A4D1N5 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
A4D1N5 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
A4D1N5 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
A4D1N5 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
A4D1N5 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
A4D1N5 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
A4D1N5 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
A4D1N5 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
A4D1N5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
A4D1N5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
A4D1N5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
A4D1N5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
A4D1N5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
A4D1N5 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
A4D1N5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
A4D1N5 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
A4D1N5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
A4D1N5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
A4D1N5 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
A4D1N5 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
A4D1N5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
A4D1N5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms