Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X3

CCL27, C-C motif chemokine 27, humanhuman

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL27Q9Y4X3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCL27Q9Y4X3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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