Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC8Q9Y2L5 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms