Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
USP18Q9UMW8 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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