Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
TRAPPC2LQ9UL33 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms