Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL19

RARRES3, Retinoic acid receptor responder protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES3Q9UL19 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RARRES3Q9UL19 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms