Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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RABGEF1Q9UJ41 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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RABGEF1Q9UJ41 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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RABGEF1Q9UJ41 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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RABGEF1Q9UJ41 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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RABGEF1Q9UJ41 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RABGEF1Q9UJ41 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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