Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CHRNA9Q9UGM1 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CHRNA9Q9UGM1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms