Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLKQ9UBT6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms