Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SPASTQ9UBP0 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms