Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
KLHL13Q9P2N7 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms