Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KLHL9Q9P2J3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KLHL9Q9P2J3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms