Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MBD5Q9P267 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MBD5Q9P267 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms