Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ABCC13Q9NSE7 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms