Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SPHK2Q9NRA0 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SPHK2Q9NRA0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SPHK2Q9NRA0 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms