Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MEPEQ9NQ76 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MEPEQ9NQ76 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms