Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ASCL3Q9NQ33 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms