Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI1

BRD7, Bromodomain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD7Q9NPI1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.08■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
BRD7Q9NPI1 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms