Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
IL1RAPQ9NPH3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms