Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PTPRHQ9HD43 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms