Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NRDE2Q9H7Z3 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms