Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHACTR1Q9C0D0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHACTR1Q9C0D0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHACTR1Q9C0D0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PHACTR1Q9C0D0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PHACTR1Q9C0D0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHACTR1Q9C0D0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHACTR1Q9C0D0 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHACTR1Q9C0D0 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHACTR1Q9C0D0 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PHACTR1Q9C0D0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHACTR1Q9C0D0 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHACTR1Q9C0D0 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PHACTR1Q9C0D0 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PHACTR1Q9C0D0 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHACTR1Q9C0D0 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PHACTR1Q9C0D0 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PHACTR1Q9C0D0 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms