Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PACSIN1Q9BY11 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms